MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Acidiphilium multivorum AIU301 plasmid pACMV4

Total Repeats: 905

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015188	CGC	2	6	22249	22254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325169026
502	NC_015188	CCG	2	6	22256	22261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325169026
503	NC_015188	CCGC	2	8	22331	22338	0 %	0 %	25 %	75 %	325169026
504	NC_015188	ACC	2	6	22377	22382	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325169026
505	NC_015188	TCC	2	6	22384	22389	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325169027
506	NC_015188	TCC	2	6	22414	22419	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325169027
507	NC_015188	CGCAG	2	10	22439	22448	20 %	0 %	40 %	40 %	325169027
508	NC_015188	CCT	2	6	22466	22471	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325169027
509	NC_015188	CCAC	2	8	22498	22505	25 %	0 %	0 %	75 %	325169027
510	NC_015188	TCG	2	6	22522	22527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325169027
511	NC_015188	CA	3	6	22548	22553	50 %	0 %	0 %	50 %	325169027
512	NC_015188	GCTAC	2	10	22573	22582	20 %	20 %	20 %	40 %	325169027
513	NC_015188	GGCAT	2	10	22606	22615	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
514	NC_015188	AAT	2	6	22709	22714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_015188	ATT	2	6	22720	22725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_015188	ATTTT	2	10	22771	22780	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_015188	GTT	2	6	22837	22842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325169028
518	NC_015188	ACCCAC	2	12	22843	22854	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325169028
519	NC_015188	GT	3	6	22865	22870	0 %	50 %	50 %	0 %	325169028
520	NC_015188	AGC	2	6	22929	22934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325169028
521	NC_015188	GATG	2	8	23026	23033	25 %	25 %	50 %	0 %	325169028
522	NC_015188	TTC	2	6	23087	23092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325169028
523	NC_015188	CGC	2	6	23107	23112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325169028
524	NC_015188	TGG	2	6	23127	23132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325169028
525	NC_015188	GTC	2	6	23171	23176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325169028
526	NC_015188	CGA	2	6	23212	23217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325169028
527	NC_015188	ACA	2	6	23250	23255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325169028
528	NC_015188	CGA	2	6	23344	23349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325169028
529	NC_015188	TCC	2	6	23390	23395	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325169028
530	NC_015188	GCG	2	6	23428	23433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325169028
531	NC_015188	GC	3	6	23472	23477	0 %	0 %	50 %	50 %	325169028
532	NC_015188	CTGG	2	8	23561	23568	0 %	25 %	50 %	25 %	325169028
533	NC_015188	GCC	2	6	23580	23585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325169028
534	NC_015188	GCG	2	6	23602	23607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325169028
535	NC_015188	GC	3	6	23684	23689	0 %	0 %	50 %	50 %	325169028
536	NC_015188	AACGG	2	10	23695	23704	40 %	0 %	40 %	20 %	325169028
537	NC_015188	ACG	2	6	23712	23717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325169028
538	NC_015188	GGC	2	6	23768	23773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325169028
539	NC_015188	CGT	2	6	23782	23787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325169028
540	NC_015188	TAG	2	6	23873	23878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
541	NC_015188	TCG	2	6	23953	23958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_015188	AC	3	6	23975	23980	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
543	NC_015188	GT	3	6	23985	23990	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
544	NC_015188	TGC	2	6	23995	24000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_015188	TTA	2	6	24082	24087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_015188	ATT	2	6	24183	24188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_015188	TCT	2	6	24208	24213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_015188	TAA	2	6	24259	24264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_015188	GC	3	6	24268	24273	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
550	NC_015188	TAT	2	6	24297	24302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_015188	ATCT	2	8	24459	24466	25 %	50 %	0 %	25 %	325169029
552	NC_015188	TGC	2	6	24625	24630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325169029
553	NC_015188	TGC	2	6	24688	24693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325169029
554	NC_015188	TGC	2	6	24751	24756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325169029
555	NC_015188	CA	3	6	24765	24770	50 %	0 %	0 %	50 %	325169029
556	NC_015188	TCC	2	6	24827	24832	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325169029
557	NC_015188	GGA	2	6	24840	24845	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325169029
558	NC_015188	CAC	2	6	24852	24857	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325169029
559	NC_015188	GAGG	2	8	24909	24916	25 %	0 %	75 %	0 %	325169029
560	NC_015188	CG	3	6	24926	24931	0 %	0 %	50 %	50 %	325169029
561	NC_015188	TGC	2	6	24975	24980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325169029
562	NC_015188	GTC	2	6	24989	24994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325169029
563	NC_015188	AGCC	2	8	24997	25004	25 %	0 %	25 %	50 %	325169029
564	NC_015188	TGA	2	6	25069	25074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325169029
565	NC_015188	CCG	2	6	25103	25108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325169029
566	NC_015188	CAT	2	6	25109	25114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325169029
567	NC_015188	TATCC	2	10	25125	25134	20 %	40 %	0 %	40 %	325169029
568	NC_015188	TCGCT	2	10	25142	25151	0 %	40 %	20 %	40 %	325169029
569	NC_015188	GAG	2	6	25187	25192	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325169029
570	NC_015188	TCATC	2	10	25249	25258	20 %	40 %	0 %	40 %	325169029
571	NC_015188	TCA	2	6	25314	25319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325169029
572	NC_015188	CGA	2	6	25330	25335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325169029
573	NC_015188	TTC	2	6	25431	25436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325169029
574	NC_015188	CGA	2	6	25525	25530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325169029
575	NC_015188	TCC	2	6	25541	25546	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325169029
576	NC_015188	ATCCA	2	10	25674	25683	40 %	20 %	0 %	40 %	325169029
577	NC_015188	TGC	2	6	25689	25694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325169029
578	NC_015188	TC	3	6	25808	25813	0 %	50 %	0 %	50 %	325169029
579	NC_015188	TTC	2	6	25818	25823	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325169029
580	NC_015188	CG	3	6	25848	25853	0 %	0 %	50 %	50 %	325169029
581	NC_015188	GAA	2	6	25982	25987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325169029
582	NC_015188	TAT	2	6	26005	26010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325169029
583	NC_015188	CGC	2	6	26035	26040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325169029
584	NC_015188	GTG	2	6	26070	26075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325169029
585	NC_015188	AAC	2	6	26093	26098	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325169029
586	NC_015188	CTT	2	6	26183	26188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325169029
587	NC_015188	TCC	2	6	26259	26264	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325169029
588	NC_015188	CAG	2	6	26288	26293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325169029
589	NC_015188	TGG	2	6	26371	26376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325169029
590	NC_015188	GAA	2	6	26384	26389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325169029
591	NC_015188	TGT	2	6	26410	26415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325169029
592	NC_015188	AT	4	8	26451	26458	50 %	50 %	0 %	0 %	325169029
593	NC_015188	TG	3	6	26468	26473	0 %	50 %	50 %	0 %	325169029
594	NC_015188	CGC	2	6	26514	26519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325169029
595	NC_015188	AGA	2	6	26520	26525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325169029
596	NC_015188	GTC	2	6	26582	26587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325169029
597	NC_015188	AAG	2	6	26669	26674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325169030
598	NC_015188	AGC	2	6	26694	26699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325169030
599	NC_015188	GCCGGC	2	12	26711	26722	0 %	0 %	50 %	50 %	325169030
600	NC_015188	CGG	2	6	26838	26843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325169030
601	NC_015188	TGG	2	6	26845	26850	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325169030
602	NC_015188	GGCC	2	8	26983	26990	0 %	0 %	50 %	50 %	325169030
603	NC_015188	GGCT	2	8	27018	27025	0 %	25 %	50 %	25 %	325169030
604	NC_015188	GAAC	2	8	27037	27044	50 %	0 %	25 %	25 %	325169030
605	NC_015188	CCG	2	6	27048	27053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325169030
606	NC_015188	GCG	3	9	27057	27065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325169030
607	NC_015188	TGG	3	9	27067	27075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325169030
608	NC_015188	CCTTGC	2	12	27115	27126	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	325169030
609	NC_015188	AGCC	2	8	27281	27288	25 %	0 %	25 %	50 %	325169030
610	NC_015188	CCAG	2	8	27292	27299	25 %	0 %	25 %	50 %	325169030
611	NC_015188	GCCTCG	2	12	27321	27332	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	325169030
612	NC_015188	CCA	2	6	27342	27347	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325169030
613	NC_015188	GC	3	6	27356	27361	0 %	0 %	50 %	50 %	325169030
614	NC_015188	CCT	2	6	27364	27369	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325169030
615	NC_015188	GC	3	6	27380	27385	0 %	0 %	50 %	50 %	325169030
616	NC_015188	GTCG	2	8	27473	27480	0 %	25 %	50 %	25 %	325169030
617	NC_015188	CGG	2	6	27562	27567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325169030
618	NC_015188	CGC	2	6	27676	27681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325169030
619	NC_015188	GC	4	8	27713	27720	0 %	0 %	50 %	50 %	325169030
620	NC_015188	TCG	2	6	27729	27734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325169030
621	NC_015188	CCAT	2	8	27741	27748	25 %	25 %	0 %	50 %	325169030
622	NC_015188	CCA	2	6	27769	27774	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325169030
623	NC_015188	CGC	2	6	27803	27808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325169030
624	NC_015188	GAT	2	6	27893	27898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325169030
625	NC_015188	ATC	2	6	27929	27934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325169030
626	NC_015188	CGG	2	6	27953	27958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325169030
627	NC_015188	TCC	2	6	27966	27971	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
628	NC_015188	ATG	2	6	27983	27988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
629	NC_015188	GA	3	6	28003	28008	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
630	NC_015188	ACC	2	6	28021	28026	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
631	NC_015188	GCCA	2	8	28096	28103	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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892	NC_015188	G	6	6	40033	40038	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
893	NC_015188	TTC	2	6	40060	40065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
894	NC_015188	GGC	2	6	40083	40088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
895	NC_015188	TCA	2	6	40144	40149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
896	NC_015188	GATTCG	2	12	40177	40188	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
897	NC_015188	CGA	2	6	40215	40220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325169045
898	NC_015188	CGCC	2	8	40227	40234	0 %	0 %	25 %	75 %	325169045
899	NC_015188	GTT	2	6	40272	40277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325169045
900	NC_015188	CGA	2	6	40308	40313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325169045
901	NC_015188	AGG	2	6	40379	40384	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325169045
902	NC_015188	CGGG	2	8	40426	40433	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
903	NC_015188	T	6	6	40509	40514	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
904	NC_015188	CTG	2	6	40536	40541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
905	NC_015188	GGA	2	6	40578	40583	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

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